Para peneliti telah menemukan bahwa hampir tiga perempat populasi membawa unsur genetik yang baru diidentifikasi yang disebut Inocles, yang dapat mempengaruhi kesehatan mulut, kekebalan, dan risiko kanker.
Para peneliti di Tokyo University dan Collaborator telah mengungkapkan penemuan mengejutkan di mulut manusia: Inocles, Masif DNA Elemen yang sampai sekarang tidak dipertimbangkan. Struktur ini tampaknya penting untuk membantu bakteri menyesuaikan diri dengan lingkungan oral yang selalu berubah. Temuan ini memberi cahaya baru tentang bagaimana bakteri membangun diri dan bertahan hidup di mulut, dengan kemungkinan konsekuensi bagi kesehatan manusia, penyakit, dan penelitian mikrobioma.
Tinjau mikrobioma oral
Tampaknya perawatan modern telah memetakan setiap detail tubuh manusia. Tetapi dalam dekade terakhir, para peneliti telah mengidentifikasi organ -organ kecil yang sebelumnya tidak diketahui, dan satu bidang yang mengalami kebangkitan penemuan adalah studi microbiome.
Ini termasuk tidak hanya microbiome usus tetapi juga mikrobioma oral. Menggambar inspirasi dari laporan baru tentang DNA yang tidak biasa dalam mikrobioma tanah, rekan peneliti proyek Yuya Kiguchi dan timnya memeriksa koleksi besar sampel air liur yang dikumpulkan oleh Yutaka Suzuki Lab di Perbatasan Sekolah Pascasarjana, Universitas Tokyo. Mereka berangkat untuk menentukan apakah elemen DNA tersembunyi yang serupa dapat ditemukan dalam air liur manusia.
“Kami tahu bahwa ada banyak jenis bakteri dalam mikrobioma oral, tetapi banyak fungsi dan cara untuk menjalankan fungsi masih belum diketahui,” kata Kiguchi. “Dengan menjelajahi ini, kami menemukan Inocles, contoh DNA ekstrakuromal – potongan DNA di dalam sel, dalam hal ini bakteri, tetapi di luar DNA utama mereka. Ini seperti menemukan buku dengan catatan kaki tambahan, dan kami baru saja mulai membacanya untuk mengetahui apa yang mereka lakukan.”
Terobosan sekuensing lebih lanjut
Mengidentifikasi Inocles terbukti menantang karena metode sekuensing standar memecah bahan genetik menjadi fragmen, sehingga tidak mungkin untuk menyatukan elemen besar. Untuk mengatasi hal ini, para peneliti menggunakan teknologi urutan membaca yang lama yang mampu menangkap bentangan DNA yang diperluas.
Langkah besar di masa depan berasal dari penulis pertama Nagisa Hamamoto, yang menciptakan teknik yang disebut Prenuc yang secara selektif menghilangkan DNA manusia dari sampel air liur, sangat ditingkatkan ketepatan Urutan fragmen panjang dari DNA lain. Dengan pendekatan ini, tim dapat mengumpulkan genom inocle lengkap untuk pertama kalinya, menemukan bahwa mereka dipegang oleh bakteri Streptococcus salivariusMeskipun menentukan host itu sendiri adalah tugas yang kompleks.
“Ukuran genom rata -rata dari inocle adalah 350 kilobase pasangan, panjang untuk urutan genetik, sehingga itu adalah salah satu elemen genetik terbesar dari mikrobiomal manusia. Kigucch,” kata Kiguchas, “kata Kiguchas,”. “Panjang ini melimpahkan inocles dengan gen untuk berbagai fungsi, termasuk resistensi terhadap stres oksidatif, peningkatan kerusakan DNA, dan gen yang terkait dengan dinding sel, mungkin terlibat dalam beradaptasi dengan respons stres ekstraseluler.”
Arah penelitian di masa depan
Tim ini bertujuan untuk mengembangkan metode yang stabil untuk memuliakan bakteri yang mengandung Inocle. Ini akan memungkinkan mereka untuk menyelidiki bagaimana fungsi Inocles, apakah mereka dapat menyebar di antara individu, dan bagaimana mereka dapat mempengaruhi kondisi kesehatan mulut seperti rongga dan penyakit gusi. Karena banyak gen inocle tetap tidak masuk, para peneliti akan menggunakan campuran eksperimen laboratorium dan simulasi komputasi, seperti Alphafold, untuk memprediksi dan memodelkan peran yang dapat dimainkan oleh Inocles.
“Yang luar biasa adalah bahwa, mengingat bahwa berbagai populasi manusia yang diwakili oleh sampel air liur, kami pikir 74% dari semua manusia mungkin memiliki inokles. Dan meskipun mikrobioma oral telah lama dipelajari, inokles tetap tersembunyi sejauh ini karena keterbatasan teknologi,” kata Kiguchi. “Sekarang kita tahu mereka ada, kita dapat mulai mengeksplorasi bagaimana mereka membentuk hubungan antara manusia, mikroba residen mereka, dan kesehatan mulut kita. Dan bahkan ada beberapa petunjuk bahwa Inocles dapat berfungsi sebagai penanda untuk penyakit serius seperti kanker.”
Referensi: “Elemen Ekstrachromosomal Raksasa” Inocle “berpotensi memperluas kapasitas adaptif manusia R. runtuwene, Nagusa Hamamoto, Yuta Kuze, Taho, Tahora, Shun-ichiro Kageyama, Takaio Fujisawa, Riu Yamashitai, Akinori Kageyama, JOSEPUO, RIU YAMASHITAA, AKINEORI, AKINEORI KAIDAO, RIU YAMASHITAA, AKINEORI, AKINEORI KAIDAO, RIU YAMASHITIA, AKINOUNI, AKINEORI KAIDAORI, RIU YAMASHITAI, AKINEORI, AKINEORI KAIDAORI, RIU YAMASHITI, Andi Yutaka Suzuki, 11 Agustus 2025, Komunikasi alami.
Dua: 10.1038/S41467-025-62406-5
Studi ini didukung oleh hibah dari Institute for Fermentasi, Osaka (Y-2022-1-010), Badan Penelitian dan Pengembangan Medis Jepang (AMED) (22FK0108538S0201), dan JSPS Kakenhi (24K18092) ke Y.Kiguchi, hibah dari JSPS dari JSPS KKK (JSPSPSPK (JSPS KKIGKI dari JSPS dari JSPS dari JSPSPSPSP KINGKPK (JSPSPS KKIGKI DARI JSPS DARI JSPS dari JSPSPSPSPSPSPSPSPKEPSPKIN
Jangan pernah melewatkan terobosan: Bergabunglah dengan Buletin ScitechDaily.
NewsRoom.id
